מבוא לביואינפורמטיקה -חלק א

שלום לכולם, בסדרת הפוסטים זו נעשה סדר במושגים של הביואינפורמטיקה , נתחיל במבוא אליה וננסה להכנס לקרביים שלה על ידי כמה שיותר דוגמאות חיות והפניות לכלים רלוונטים רוב המחקר הביולוגי נעזר בסוגים שונים של יישומים מתמטים, סטטיסטיים או כלי חישוב…

הכנה לאנליזת רצפים של המיקרוביום

בפוסט הקודם על חקר המיקרוביום סיימנו עם כמות גדולה מאד של רצפים שהופקו על ידי מכשיר ה-PCR. בפוסט הזה נמשיך ונראה אלו תהליכים הרצפים שלנו צריכים לעבור על מנת שנפיק מהם את המידע שאנו רוצים הפוסט הוא תאורטי ולא נכנס…

חקר המיקרוביום – איך זה עובד

בפוסט הקודם למדנו מהם מיקרוביום, מיקרוביוטא, ומטא-גנום.בקצה המזלג למדנו את שיטות הריצוף Shotgun sequencing וריצוף מכוון, וראינו שעל מנת לקבל מידע שהוא הרבה יותר רלוונטי לשלב ראשוני של המחקר אנחנו צריכים לרצף בשיטת ריצוף מכוון רצף שמכיל גם אזורים שמורים…

מיקרוביום

חקר המיקרוביום מהו מיקרוביום? מהו מטאגנום? ומהי מיקרוביוטא? ואיך עושים להם אנליזה?קצת רקע (בהמשך קצת פרקטיקה) מיקרוביוטה, מטא-גנום ומיקרוביום הן שלוש מילים המייצגות את המגמה ההולכת וגוברת של השנים האחרונות במעבדות מיקרוביולוגיה. מאחורי מילים אלו מוסתרות התשובות למחלות רבות כגון…