מבוא לביואינפורמטיקה – חלק ב

שלום לכם, בפוסט לפנינו: נבין את החשיבות של העמדת רצפים, נלמד להכיר איך נראית העמדת רצפים ונלמד מהם העמדה מקומית והעמדה גלובלית. העמדת רצפים להלן רצף של DNA: והנה רצף של חלבון: כאשר אנחנו מתבוננים ברצף כלשהוא, זה יכול להיות…

הכנה לאנליזת רצפים של המיקרוביום

בפוסט הקודם על חקר המיקרוביום סיימנו עם כמות גדולה מאד של רצפים שהופקו על ידי מכשיר ה-PCR. בפוסט הזה נמשיך ונראה אלו תהליכים הרצפים שלנו צריכים לעבור על מנת שנפיק מהם את המידע שאנו רוצים הפוסט הוא תאורטי ולא נכנס…

חקר המיקרוביום – איך זה עובד

בפוסט הקודם למדנו מהם מיקרוביום, מיקרוביוטא, ומטא-גנום.בקצה המזלג למדנו את שיטות הריצוף Shotgun sequencing וריצוף מכוון, וראינו שעל מנת לקבל מידע שהוא הרבה יותר רלוונטי לשלב ראשוני של המחקר אנחנו צריכים לרצף בשיטת ריצוף מכוון רצף שמכיל גם אזורים שמורים…

מיקרוביום

חקר המיקרוביום מהו מיקרוביום? מהו מטאגנום? ומהי מיקרוביוטא? ואיך עושים להם אנליזה?קצת רקע (בהמשך קצת פרקטיקה) מיקרוביוטה, מטא-גנום ומיקרוביום הן שלוש מילים המייצגות את המגמה ההולכת וגוברת של השנים האחרונות במעבדות מיקרוביולוגיה. מאחורי מילים אלו מוסתרות התשובות למחלות רבות כגון…